加蓬全境由赤道貫穿，氣候是典型的熱帶雨林氣候，年均氣溫在26-28℃，全年炎熱潮濕，但溫差不大。共分為四季：大雨季從2月中旬-5月中旬；大旱季從5月中旬到9月中旬；小雨季從9月中旬到12月中旬；小旱季從12月中旬到翌年2月中旬。
        年降水量維持在2000-3000毫米左右。除了大部分熱帶雨林氣候，南部極少地區屬于熱帶草原氣候，分為干濕兩季，交互更替，時間與北半球的熱帶草原氣候相反。